本节主要收集一些Seurat分析流程图集以及了解到的分析过程中需要注意的问题。
分析注意点
- 单细胞差异分析需选用RNA assay；
- 多样本数据整合后，进行FindAllMarker分析同样需要使用RNA assay；
- 鉴定每个分群中的保守基因，需要使用Findconservedmarkers函数；
- 针对大型数据可以采用loom文件格式，这样避免一次性将所有数据输入内存当中；
本节主要收集一些Seurat分析流程图集以及了解到的分析过程中需要注意的问题。
