Biomarker 生物标志物概念
生物标志物(Biomarker)是指可以标记系统、器官、组织、细胞及亚细胞结构或功能的改变或可能发生的改变的生化指标,具有非常广泛的用途。生物标志物可用于疾病诊断、判断疾病分期或者用来评价新药或新疗法在目标人群中的安全性及有效性。
生物标志物大可分为三类: 1、可随着时间追踪疾病进展和已知临床检测相关的指标。 2、可以探测药物效果的指标。 3、可以作为临床试验终点的评价指标。
分子生物标志物:确定标准
生物标志物的分类有很多,比如简单分子,复杂分子,比如细胞,抗体,临床表型等等。
涉及到分子标志物的,大概可以分为基因、蛋白质、DNA 序列、线粒体、RNA、miRNA、代谢组、SNP、单体型等等。
一个理想的生物标志物应该有如下特征:
1、必须明确的与一个特定的疾病或者疾病状态相关,并能够区分相似的生理状态。
2、要是标准的生物源,比如血清和尿液。
3、要有一种快速的、简便、准确以及廉价的 marker 检测防范,还要有可衡量的参考标准基线。
鉴定生物标志物,生物信息是基础,大样本、多组学才是王道。
诊断模型和预后模型:riskscore 线性方式、单因素 cox+PCA 模型、随机森林+人工神经网络模型:Gene_Score* Gene_Weight、cox 回归+PCA+CIHI 、常微分方程动态模型、分类和回归树+单因素 cox、混合离散连续体(HDC)模型、GuanRank+GPR、FPC+cox 回归